PCR Clean™祛除DNA的效果检测

分子实验是生物学研究过程中常用的实验技术。随着这类技术的普及与高度运用，科研人员发现，DNA污染会PCR分子生物学实验的准确性和灵敏性。

德国Minerva Biolabs公司针对实验室常用的核酸污染祛除试剂，在常见的仪器、物品的污染祛除效果进行了检测，并对其结果进行了详细的阐释。

检测PCR Clean™祛除大肠杆菌0104和大肠杆菌0157中细菌扩增子DNA的效率，并与其他几种清洁材料进行比较。

将2µl （0.05 ng）大肠杆菌0104 DNA移入塑料箔、玻璃表面和实验室工作表面（Trespa®），或将2µl （0.2 ng）大肠杆菌0157 DNA、大肠杆菌质粒DNA移至有机玻璃®和铝表面。

在DNA完全风干后，使用一张纸巾，用PCR Clean™、稀释的洗洁精、70%乙醇、异丙醇、水或干纸巾湿润后，分别轻轻擦去DNA滴入的地方，将DNA祛除。

然后用湿润的棉签擦拭同一区域来收集样本。作为阳性对照，直接将0.05 ng大肠杆菌0104 DNA（用于塑料箔，玻璃或Trespa®检测）、0.2 ng大肠杆菌0157 DNA（用于有机玻璃®和铝检测）2 ×10^6基因组拷贝的大肠杆菌基因组DNA或2 ×10^6基因组拷贝的大肠杆菌质粒DNA，移液到250µl PCR级水中，并以与其他样品相同的方式进行提取。

结果显示，与其他清洗剂和阳性对照相比，PCR Clean™从测试的各个表面祛除扩增子DNA后，扩增子DNA的损耗更大（表1）。对于所有测试的表面，PCR Clean™显示出祛除扩增子DNA的**效果，这可以在图1中观察到。无论表面材料如何（图1，a - e）， PCR Clean™的Ct值均高于其他清洗剂和阳性对照（图1，a - e），表明DNA量减少幅度较大。

表1.使用PCR Clean™与其他清洗剂比较，从不同表面祛除扩增子DNA后的qPCR扩增的ct值。

图1.使用不同清洗剂从a . plexglass®、B. aluminum、C. Trespa®、D.Glass和E. Plastic foil中祛除大肠杆菌扩增子DNA后的qPCR扩增曲线（详见上图）。

结果显示，与水和干纸巾相比，用PCR Clean™从铝表面祛除基因组DNA和质粒DNA后，与阳性对照相比，基因组DNA和质粒DNA的损耗更大（表2）。这也可以在图2中显示，其中基因组DNA扩增的ct值(图2，A)和PCR Clean™祛除后质粒DNA扩增的ct值（图2，B）高于其他清洗剂祛除后的ct值，也高于阳性对照，表明DNA量减少幅度更大。

表2.使用PCR Clean™从铝表面祛除基因组DNA或质粒DNA后，与水和干纸巾进行比较，用qPCR扩增测量ct值。

图2。使用PCR Clean™、H₂O或干纸巾从铝表面祛除后，大肠杆菌基因组DNA或大肠杆菌质粒DNA的qPCR扩增曲线